موضوع مهم در راه اندازي تمام انواع پايگاه‌هاي اينترنتي، توجه به نحوه مديريت اطلاعات ارايه شده از سوي آنهاست. طبيعي است كه هر پايگاهي- حتي اگر داراي بهترين طراحي و رنگ‌بندي باشد- چنانچه اطلاعات مورد نظر كاربران را در اختيار آنها قرار ندهد، كارآيي خود را از دست خواهد داد. مديريت محتواي پايگاه‌هاي اينترنتي زماني اهميت بيشتري مي يابد كه اطلاعات پايگاه به سرعت تغيير كنند. براي نگهداري پايگاه‌هاي اينترنتي دو راهكار اساسي وجود دارد:

الف - مديريت بدون استفاده از برنامه‌هاي مديريت وبگاه

روش سنتي و مرسوم راه‌اندازي پايگاه‌هاي اينترنتي كم حجم و كم محتوا، مديريت بدون مستند سازي و بدون استفاده از نرم‌افزار يا برنامه خاص مي‌باشد كه از مراحل ثبت نام وبگاه، تامين فضا و ايجاد تظاهر و محتوي تشكيل مي‌شود. اين نوع وبگاه‌ها به طور معمول عجولانه، اتفاقي و بدون بررسي اوليه و بر اساس وظايف سازماني يا تحميل شده شكل مي‌گيرند و به دليل فقدان اهداف مشخص و مكتوب راه به جايي نمي‌برند. اين نوع از پايگاه‌ها كه بيشتر توسط مديران كم تجربه هدايت مي‌شوند و با كمك طراحان وب مبتدي پديد مي‌آيند، جرياني خطي و يكسويه از اطلاعات برقرار مي‌كنند و به‌طور معمول از برنامه منظمي براي به‌روزرساني برخوردار نيستند.

ب - مديريت هدفمند و با استفاده از برنامه‌هاي مديريت وبگاه

با افزايش حجم تبادلات و تحولات در پايگاه‌هاي اينترنتي گسترده و پرمحتوا، روش‌هاي سنتي ناكارآمدي خود را بروز دادند. در اين راستا برنامه‌نويسان اين نوع پايگاه‌هاي ابزارهاي جديدي ابداع نمودند تا امر به‌روزرساني و تغيير محتواي پايگاه‌ها را به صورت پويا، ساده و پرسرعت فراهم كنند. اين نوع نرم‌افزارها كه به طور كلي "سيستم‌ها مديريت محتوا" ( Content Management System ) ناميده مي‌شوند، امكان انجام تغييرات لازم و همچنين اقداماتي همچون مديريت كاربران، برقراري ارتباط دوسويه، آمارگيري و گزارش‌گيري از بانك اطلاعاتي پايگاه، و تغييرات ظاهر پايگاه را فراهم مي‌سازند. امروزه با افزايش تعداد اين نوع برنامه‌ها به ويژه در سيستم‌هاي منبع باز مانند سيستم‌هاي مبني بر Unix ، استفاده از آنها گسترش يافته است.