نظام رتبه بندی لایدن هر ساله توسط مرکز مطالعات علوم و فناوری  (CWTS) دانشگاه لایدن هلند منتشر می شود. این رتبه بندی بر اساس الگوریتمهای بسیار پیشرفته و اصول منحصراً علمی و شاخصهای پیشرفته علم سنجی (نظیر شاخصهای تاثیر استنادی TCS, TNCS, MCS, MNCS, PP(top۱%,۱۰%,۵۰%)) و شاخصهای همکاری علمی (بین موسسه ای، بین المللی، با صنعت، فاصله جغرافیایی کمتر از ۱۰۰ کیلومتر و بیشتر از ۵۰۰۰ کیلومتر) محاسبه می شود.

داده های نظام رتبه بندی لایدن بر پایه آثار پژوهشی نمایه شده در پایگاه های استنادی تامسون رویترز (ISI) قراردارد. رتبه بندی سال ۲۰۱۵، آثار علمی (مقالات و مقالات مروری بغیر از مقالات همایشهای علمی، کتب و مجلات نمایه نشده در پایگاه ISI) که توسط ۷۵۰ دانشگاه جهان در مجلات علمی بین المللی در بین سالهای ۲۰۱۰ الی ۲۰۱۳ منتشر شده اند را پوشش می دهد.

 در رتبه بندی جدید لایدن (۲۰۱۵)، ۱۳ دانشگاه ایران با بالاترین میزان انتشارات علمی در در میان ۷۵۰ دانشگاه برتر جهان حضور دارند. در نظام رتبه بندی دانشگاههای لایدن، بسته به شاخص تعداد انتشارات، شاخصهای تاثیر استنادی و شاخصهای همکاری علمی، دانشگاهها از جایگاه متغیری برخوردار هستند. از نظر شاخص همکاری، دانشگاه علوم پزشکی تهران از بیشترین میزان همکاری بین موسسه ای، دانشگاه صنعتی اصفهان بیشترین میزان همکاری بین المللی و دانشگاه تهران از بیشترین میزان همکاری با صنعت برخوردار هستند.

دانشگاه صنعتی اصفهان از خدمات شرکت یکتاوب برای برپایی سامانه های تعدادی از نشریات خود استفاده کرده است.